これは、<number> では、実際に配下のカテゴリに登録されている商品だけの個数となりますが、<cate-under> では、配下にリンクカテゴリがある場合、そのリンク先のカテゴリの商品数もプラスされて表示されるためです。
<cate-under> で、配下のリンクカテゴリのリンク先のカテゴリの商品数をプラスしなければ、配下のカテゴリがリンクカテゴリしかない場合に、<cate-under> で表示される商品数も「0」となってしまい(実際には商品数が「0」のカテゴリは表示されません)、そのカテゴリが表示されなくなってしまうことを避けるための仕様になります。
もし、このように商品数が違ってしまうことが嫌な場合、リンクカテゴリは使わずに、それぞれの商品毎に、複数のカテゴリを指定してやると商品数の表示が違ってくることはありません。
